Umat manusia akhirnya melepaskan diri dari Godzilla, memenjarakannya di sebuah makam es di Kutub Selatan. Semuanya damai sampai berbagai monster muncul untuk menghancurkan kota-kota di Bumi. Kewalahan, umat manusia tampaknya diselamatkan oleh ras alien baik hati yang dikenal sebagai Xiliens. Namun tidak semuanya seperti yang terlihat pada pengunjung aneh ini. Jika umat manusia ingin bertahan hidup, mereka harus dengan enggan membangkitkan musuh yang paling mereka benci, Godzilla.