Seorang ahli bioarkeologi muda Yukisuke tertarik pada seorang gadis Koyomi, yang menjalankan kios kecil kue taiyaki yang sering dia beli. Namun Koyomi dirawat di rumah sakit karena kecelakaan mobil di hari hujan setelah mereka pergi bersama, dan terbangun dengan kehilangan ingatan jangka pendek, di mana dia tidak dapat mengingat apa pun selain hari ini. Yukisuke mencoba untuk hidup dekat dengannya seperti sebelumnya tetapi kurangnya ingatan kolektif mulai membuatnya terhuyung.